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  全基因组测序数据获取后应该怎么分析?

  你需要明确你最终要得到什么输出。 如果想用你现有的数据建模型进行诊断或预测,出门左拐生统和机器学习。 如果想用你现有的数据注释新的基因,出门右拐自然语言处理与基因组组装。 如果想用你现有的数据找疾病相关的基因/通路/网络,出门直走差异表达分析。然而首先你得有一...

  2024-07-16 网络 更多内容 839 ℃ 488
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  全基因组测序数据获取后应该怎么分析

  测序数据一般是fasta格式的序列文件,采用bwa等类似的比对软件比对到参考基因组上,根据比对位置可以注释到某个基因,然后得到该基因某个位置的基因型信息

  2024-07-16 网络 更多内容 271 ℃ 119
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  全基因组测序数据获取后应该怎么分析

  宏基因组是指特定环境中全部生物(微生物)遗传物质的总和。宏基因组测序是利用高通量测序技术对环境样品中全部微生物的基因组进行测定,以获得单个样品的饱和数据量,可进行微生物群体的基因组成及功能注释,微生物群体的物种分类,多样性分析,群落结构分析,样品间的物种或基因...

  2024-07-16 网络 更多内容 401 ℃ 791
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  如何对基因测序结果进行分析

  可以用另一端的引物进行测序,从另一端测序可以一直测到序列的末端,握游就可以在序列的末端得到您的引物的反向互补序列。如果想用你现有的数据找疾病相关的基因/通路/网络,出门直走差异表达分析。首先,看测序峰图,如果结果的彩图显示峰型是尖锐单一的,碱基所对应的编码是一...

  2024-07-16 网络 更多内容 176 ℃ 679
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  怎样分析基因测序结果

  1. 假设你测的是一个基因的序列,如果已知这个基因的序列,则将你测序得到的基因序列与已知的序列相比对,分析看两者在哪个地方不对应,不对应的地方即为突变的地方。比对的软件有sequencher,或者去ncbi网站点击blast进行。 2. 如果你测的是一个以前未知的序列,那么要测几个不同的...

  2024-07-16 网络 更多内容 676 ℃ 101
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  怎样分析基因测序结果

  1.假设你测的是一个基因的序列,如果已知这个基因的序列,则将你测序得到的基因序列与已知的序列相比对,分析看两者在哪个地方不对应,不对应的地方即为突变的地方.比对的软件有sequencher,或者去NCBI网站点击BLAST进行.2.如果你测的是一个以前未知的序列,那么要测几个不同的...

  2024-07-16 网络 更多内容 710 ℃ 613
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  如何分析测序结果

  你是Sanger测迹迟序还是二代测序?Sanger测序的话一般公司都会给你两个文件,一个是峰图的文件,还有个能用文本文档打开的文件,里边是姿燃李测序得到的序列段卜,峰图可以用软件打开,比如Chromas Lite是一个免费软件,网上就能下到。若是二代测序的话就需要生物信息学的人给处...

  2024-07-16 网络 更多内容 212 ℃ 505
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  怎样分析测序结果

  用Chromas等软件打开测序结果,查看峰图质量和序列是否正确。比对序列的话我个人更习惯用seqman软件

  2024-07-16 网络 更多内容 925 ℃ 377
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  如何对基因测序结果进行分析

  测序过程常见问题分析与解答1、为什么找不到pcr引物?答:以下几种情况,将无法找到做pcr时的引物序列(1)用pcr引物作为测序引物进行测序时,所测序列是从引物3’末端后第一个碱基开始的,所以自然就找不到您的引物序列了。有两种方法可以得到您的引物序列。对于较短的pcr产物(

  2024-07-16 网络 更多内容 895 ℃ 617
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  重组质粒测序后如何分析

  PCR扩增看是否有自己目的基因长度的片段被扩增,或者酶切检验,再或者融合蛋白表达看是否有相应的蛋白产生

  2024-07-16 网络 更多内容 985 ℃ 69