如何对基因测序结果进行分析
如何对基因测序结果进行分析?？
可以用另一端的引物进行测序🪄|_🪢，从另一端测序可以一直测到序列的末端🐈⬛🤬——_🌛🤫，就可以在序列的末端得到您的引物的反向互补序列🦟🎮——*🦠。如果想用你现有的数据找疾病相关的基因／通路／网络🌳|-🏒，出门直走差异表达分析🐡😏_🤭🌔。首先🐟🐓————🌩，看测序峰图🧩|——🍄，如果结果的彩图显示峰型是尖锐单一的🦝🌜-🌔🌞，碱基所对应的编码是一致的🕊🥈|🦛，那么可以判断序列是可以有帮助请点赞🐷*-🖼🐄。
1🌷🦌——😘、富集分析（KO）样品要求样品采集⛈|♥🐍：样品采集条件的一致是最为重要的环节😵🦡-🎑🐇，严格按照采样标准采样🦬🦚-😌👺，采样后立即封存样品冷冻保存🦊*|_🤢🐉。2💐🪴_-🌙、还有一段距离😁🦣-🐗，因此就可以得到您的完整的引物序列🎖🦤|🦥🥍。由于在测序的起始端总会有一些碱基无法准确读出🐺-🦢🦡，因此🤨|🌕🐣，您如果想得到您的pcr产物的完整序列🐹-😓🎈，最好克隆后进行测序😕-🐱🕊。3🐩——-😚、答案等我继续说🎣--⛳🌻。
可以用另一端的引物进行测序🪄|_🪢，从另一端测序可以一直测到序列的末端🐈⬛🤬——_🌛🤫，就可以在序列的末端得到您的引物的反向互补序列🦟🎮——*🦠。如果想用你现有的数据找疾病相关的基因／通路／网络🌳|-🏒，出门直走差异表达分析🐡😏_🤭🌔。首先🐟🐓————🌩，看测序峰图🧩|——🍄，如果结果的彩图显示峰型是尖锐单一的🦝🌜-🌔🌞，碱基所对应的编码是一致的🕊🥈|🦛，那么可以判断序列是可以有帮助请点赞🐷*-🖼🐄。
1🌷🦌——😘、富集分析（KO）样品要求样品采集⛈|♥🐍：样品采集条件的一致是最为重要的环节😵🦡-🎑🐇，严格按照采样标准采样🦬🦚-😌👺，采样后立即封存样品冷冻保存🦊*|_🤢🐉。2💐🪴_-🌙、还有一段距离😁🦣-🐗，因此就可以得到您的完整的引物序列🎖🦤|🦥🥍。由于在测序的起始端总会有一些碱基无法准确读出🐺-🦢🦡，因此🤨|🌕🐣，您如果想得到您的pcr产物的完整序列🐹-😓🎈，最好克隆后进行测序😕-🐱🕊。3🐩——-😚、答案等我继续说🎣--⛳🌻。
答🐀|-😠：一😲🐆——🐔🎣、基因测序的结果的内涵基因测序的结果是一种新型基因检测技术🎟🎲_🦄🪆，能够从血液或唾液中分析测定基因全序列🦮|🕊，预测罹患多种疾病的可能性🎁🥋--🍃，个体的行为特征及行为合理🎋*-|🎍。基因测序技术能锁定个人病变基因☁️——_🐤，提前预防和治疗🥇🤨|🦩。二🐷🦜--*、基因测序的作用锁定个人病变基因🐗_🪳，提前预防和治疗🪀|🪲。
二代测序结果分析方法如下🐜_——🐕🦺：1🏒🦏--🐑、首先😻🥈——-*，对二代测序数据进行预处理🦭|🦊💀，去除低质量的序列🌼🎋_*🦩，去除序列中的重复部分🐐|🌾。2🤣|_🥀、其次🐝-🎖，进行序列比对和变异检测*🪴_😴😶，确定每个序列在基因组上的位置是否正常☹️🤕——😇。3😵😂__🦀🎱、最后🎮🧿——|💮🎽，对比数据和检测结果😡⛈|🐜🦀，得出最终分析报告*😕|🤿🦛。
如何比对基因组测序数据??？
1🐆__🦜😾、网络搜索下载并安装BioEdit软件😐*❄_*。2😀||♟🥀、将你所要比对的序列以fasta格式粘贴在文本文档里🌘🏒_——🦅🌍。3🐾_-🦤、BioEdit软件打开文本文档😚🤩——🕸😊，选中所有的序列🦎*——🌿🏏，按下图方法选择要打开的标签🐽🦛-😠。4🌱🦙_——🪢、在新的窗口中🤿|🌞，按下图所示勾选Note下面的方框（勾选之后可以在比对的结果中用星星表示🕊🪁_🪀，方便你看出哪些地方不一致）和运行“RunClustalW等我继续说🐸🪅_🌥。
1. 假设你测的是一个基因的序列🏐🧸|🎍，如果已知这个基因的序列🤔♠——_🎮🎍，则将你测序得到的基因序列与已知的序列相比对🐆——|🧐*，分析看两者在哪个地方不对应🐰_|🎨🌻，不对应的地方即为突变的地方☘️😟——🦙🐔。比对的软件有sequencher🦠_|*，或者去NCBI网站点击BLAST进行♠*|-🐔。2. 如果你测的是一个以前未知的序列🌼😬-——🍁，那么要测几个不同的单克隆*🐳|🐙🦌，将测得的结好了吧🎎🌿-🦙！
全基因组测序分析?？
早期基因组研究已揭示🕷🏆_🎖，SNV和小插入缺失的检测深度要求显著🐔🕸-🌓，WGS的平均深度远高于WES🌩🎴|——🐈⬛，以确保精确的变异检测🧵——_*🪆。测序过程中的GC偏差和PCR扩增对覆盖深度均匀性的影响不容忽视🙉——🌗🖼，优化这些步骤是提高测序质量的关键🌿🐆_🎱。在WES中🦥🐭-🏸🌙，GC含量变化可能导致序列捕获的不均匀性**-|🦉🐚，而PCR步骤则需要更精细的优化以降低偏差🏒_*🪶。这说完了🐯|——🏆。
(1)用PCR引物作为测序引物进行测序时⚡️😿_🪢，所测序列是从引物3’末端后第一个碱基开始的😪🦢|🌔，所以自然就找不到您的引物序列了🌈🎨-🌿🏅。有两种方法可以得到您的引物序列🏈*|🌟。对于较短的PCR产物(<800bp)☹️🐍-🦈💫，可以用另一端的引物进行测序🐇——🧵，从另一端测序可以一直测到序列的末端🦜-🦉，就可以在序列的末端得到您的引物的反向互补后面会介绍🦝😵-——🐿🦄。
全基因组测序数据获取后应该怎么分析??？
如果想用你现有的数据建模型进行诊断或预测🤐————😔😝，出门左拐生统和机器学习🐁🦆——🌼。如果想用你现有的数据注释新的基因*——🐪，出门右拐自然语言处理与基因组组装🦠|-😷🪶。如果想用你现有的数据找疾病相关的基因／通路／网络🦁|🧩，出门直走差异表达分析🦙🌓-🦆🐙。然而首先你得有一架跑得起来的服务器🐱👿|——♥，其次🐜🦘|🦢，你得有自己看文献🤠|🦂🐪、不做伸手党的态度到此结束了？🐈⬛🐌__🏅😇。
测序得到基因序列后一般都需要进行序列比对🦒——🎍，看和目的序列的差异情况🤫😔_-🐵🧐，常用的软件有DNAman,还有invitrogen的vectorVI也不错🐷🐡|——🧶🦭。此外还可以直接在网上进行比对🦍|——😹，推荐NCBI网站的BLAST可以直接网上进行🥏_🌵😀。不用担心🐚|_🌾，多熟悉几遍就可以操作了😜🐈|_🍃，很简单的🤪🎱_😽🀄，要对自己有信心🖼_——🐈🍀，加油🀄🦧|😉！