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如何在ncbi上进行blas

2024-07-21 04:18:19 来源:网络

如何在ncbi上进行blas

如何在ncbi上进行blast -
先打开ncbi,再打开blast,然后在Nucleotide一栏找到Nucleotide-Nucleotide blast,然后在出来的网页中把你的上游或者下游引物序列输入后,选择人还是鼠的或是其他,点BLAST即可,再出来的网页点FOMAT,即可得到结果,主要看你的基因序列是否有且到此结束了?。
打开浏览器,输入进入NCBI网站。在此网页下方处找到Primer-BLAST,点击进入。点击进入以下界面,在Primer Parameters里面输入自己已经设计好的引物序列。随后,在Primer Pair Specificity Checking Parameters里面的Databse中选择选项“Genome(chromosomes from all organisms)”。之后直接点击页眉左下角的“Get Pri到此结束了?。

如何在ncbi上进行blas

NCBI的Primer-BLAST怎么用 -
跟其它的BLAST一样,点击底部的“Advancedparameters”有的参数设置。模板(Template)在“PCRTemplate”下面的文本框,输入目标模板的序列,FASTA格式或直接用AccessionNumber。如果你在这里输入了序列,是用于引物的设计。Primer-BLAST就会根据你输入的序列设计特异性引物,并且在目标数据库(在specificitycheck区好了吧!
1、首先打开NCBI,选择“Nucleotide”,并在搜索框输入基因名。一般用目标基因的突变体1去设计引物,也就是要选择目标基因的“transcriptvariant1,mRNA”,没有1就用2、3,以此类推。因为是Q-PCR,所以要去掉内含子,因此用mRNA。2、从上一个页面点击FASTA,可以看到mRNA的序列。3、搜索“NCBIBLAST”并等我继续说。
NCBI中blast可变序列 -
NCBI中Blast可以用来进行序列比对、检验引物特异性Blast导航主页面主体包括三部分BLAST Assembled Genomes选择你要对比的物种,点击物种之后即可进入对比页面Basic BLAST包含5个常用的Blast,每一个都附有简单介绍Specialized BLAST是一些特殊目的的Blast,如Primer-BLAST、IgBLAST 根据需要做出选择点击Basic 说完了。
将需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面Enter Query Sequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的Choose Search Set中选择需要比对的数据库。Program Selection中的比对可根据个人需要进行选择。如果进行两两比对,或者多个序列的比对,在Enter Query Sequence框中选中Align 好了吧!
...想在水稻中找到他的同源序列,怎么找?ncbi里的Blastn找不到。谁...
1. 打开NCBI网站,选择“blast”链接。2. 在“blast”页面上,选择“Nucleotide BLAST”选项。3. 在“Enter query”框中,粘贴ACOS5基因的序列或输入该基因的序列号(例如:ACOS5基因的序列可在GenBank或其他数据库中获得)。4. 在“Database”框中,选择“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”或“..
首先打开NCBI主页第一步:点击下方的Blast 第二步:选择nucleotide blast,即核酸比对。第三步:出现下面页面,在框框里输入你的序列,下面有选项(老鼠的,人的,其他的),根据情况自己选择一个。第四步:点击最下方的BLAT,就开始比对了。第五步:大概等几分钟后会出现一下比对结果,以及最相近是什么。
ncbi上的blast序列比对工具怎么使用,求具体操作指南。 -
;BLAST_PROGRAMS=megaBlast&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on&LINK_LOC=blasthome 进入这个网址,把你所要比对的序列输入序列框中,在下面的选项中选择对应的物种,然后点击Blast就可以了好了吧!
登陆NCBI homepage,点击blast,然后点击nucleotide blast,在弹出的网页上Enter Query Sequence中粘贴你测序的序列。在Choose Search Set一项中,选others。其他不用管,直接点最后面的blast。然后就等比对结果,稍后就会弹出。结果你能看懂的,不解释了。