什么是深测序和重测序
什么是深测序和重测序, 以及降解组测序 -
深度测序是指对一个基因组进行多次覆盖测序，例如基因组一共只有a个碱基对，却测了4a个碱基对，相当于每个碱基对平均都被测了四次，这有利于对基因组的拼接，提高测序结果的准确性。重测序是指一个物种的基因组已经被测过一次，现在重新进行测序，重测序以首次测序的结果为参考，通过比对，能够找出同一到此结束了？。
一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定， 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing,NGS )足见其划时代的改变， 同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能， 所以又被称为深度测序(Deep sequencing)。
深度测序是指对一个基因组进行多次覆盖测序，例如基因组一共只有a个碱基对，却测了4a个碱基对，相当于每个碱基对平均都被测了四次，这有利于对基因组的拼接，提高测序结果的准确性。重测序是指一个物种的基因组已经被测过一次，现在重新进行测序，重测序以首次测序的结果为参考，通过比对，能够找出同一到此结束了？。
一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定， 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing,NGS )足见其划时代的改变， 同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能， 所以又被称为深度测序(Deep sequencing)。
从头测序是通过拼接和组装的方式获得基因组序列图谱，病毒变异率很低；重测序可以寻找出大量的单核苷酸多态性位点，插入缺失位点，结构变异位点，拷贝数变异等变异信息，从而获得生物群体的遗传特征。病毒变异率很高。乙肝病毒在医学上已经测过，只需要做重测序就可以。
测序深度（Sequencing Depth）：测序得到的碱基总量（bp）与基因组大小（Genome）的比值，它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系，测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。重测序的个体，如果采用的是双末端或Mate-Pair方案，当测序深度在10~15X以上时好了吧！
新一代测序中,基因从头测序和重测序有什么区别 -
从头测序是目前为止还没有人测过那个物种的全基因组，没有参考序列进行比对，需要自己组装拼接后才能知道序列；而重测序是已经有人测过了，只需要重新测序，有参考序列了，只需要与参考序列比对。乙肝病毒好像是已经测过的，只需要做重测序就可以！
测序深度（Sequencing Depth）：测序得到的碱基总量（bp）与基因组大小（Genome）的比值，它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系，测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。重测序的个体，如果采用的是双末端或Mate-Pair方案，当测序深度在10~15X以上时等我继续说。
什么是重测序? -
待测物种如果有发表过的参考基因组，重新进行测序就不需要拼接，可以直接对测序reads进行短序列比对。简而言之就是对基因组序列已知的物种个体进行基因组重新测序，本质就是找变异。所以我们的重测序项目下机数据都是不拼接的，
在二代测序中，为了有效覆盖全基因组，获得的数据量一般是被测基因组的几十倍，然后再拼接。也就是说，理论上，每个位点都要被覆盖几十次甚至上百次，这个次数就叫测序深度所以，二代测序也成为深度测序，
什么是深度测序? -
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序一般的方法是边合成，边测序。如通过碱基加到引物后端时所释放出的焦磷酸盐来提供检测信号。针对每种碱基的特定波长的激光激发后面会介绍。
测序深度可以理解为对一段序列上的区域重复检测的次数，比如一个序列被上某个片段被检测了30次就是30x，深度越大，越准确，覆盖度就是对你的目的基因所覆盖的程度，比如你的序列是有30bp但是由于测序的时候某些区域没有测到，只测到了27bp大小片段，那就是27/30等于90 后面会介绍。