ncbi基因芯片数据库怎么用
ncbi基因芯片数据库怎么用 -
你到GEO上注册,然后按照他们的步骤做,他们会有人联系你来确保数据质量的。格式等直接问他们就可以。通常是SOFT格式。
1。search中选择GENE,在for后填写唐朝2.在for后填写武汉人3.在for后填写mtDNA 最后在for 后填写#1 AND #2 AND #3(必须大写中间有空格)就这样交叉查询,
你到GEO上注册,然后按照他们的步骤做,他们会有人联系你来确保数据质量的。格式等直接问他们就可以。通常是SOFT格式。
1。search中选择GENE,在for后填写唐朝2.在for后填写武汉人3.在for后填写mtDNA 最后在for 后填写#1 AND #2 AND #3(必须大写中间有空格)就这样交叉查询,
你也可以用ncbi里面的homologene数据库去找种间的同源序列.multiple alignment可以用clust W或者mega做。系统发育树可以用mega做。PHYLIP好像也可以。基因结构上可以做做gc含量,外显子大小,splicing,调控序列什么的蛋白结构预测软件很多,不过我没做过。ncbi有一个conserved domain 的数据库,你可以和他比较下,分析下结构是什么。
据基因的构成原理寻找基因序列,如下:A、C、G和T分别代表组成DNA的四种核苷酸——腺嘌呤,胞嘧啶,鸟嘌呤,胸腺嘧啶。每个字母代表一种碱基,两个碱基形成一个碱基对,碱基对的配对规律是固定的,即是:A-T,C-G。典型的他们无间隔的排列在一起,例如序列AAAGTCTGAC。任意长度大于4的一串核苷酸被称作好了吧!
请教一个分子遗传学的问题,关于单突变鉴别和分离克隆的实验问题_百度知 ...
2)中技术方案:从各大数据库中搜索与水稻株高控制相关的基因,将相关的基因分别设计引物克隆出来,检查有没有SNP;或者用核酸探针杂交,或用基因芯片进行高通量测定,找到突变的基因。最后依然是设计引物克隆之。3)中技术方案:由于突变之后蛋白的表达量,分子量,等电点都可能会发生变化,可以做蛋白二维后面会介绍。