ncrna原位杂交
安利——lncRNA的亚细胞定位数据库 -
要确定特定lncRNA的活动位置,通常需要借助实验技术,如RNA免疫荧光原位杂交(RNA FISH)。在实验前,预测工具如lncATLAS(lncatlas.crg.eu/)可提供参考。该数据库以15个细胞系的高通量测序数据为基础,收录了6768个经GENCODE注释的lncRNA信息,只需在界面输入lncRNA名称或ID,即可查询其在不同细胞系中的好了吧!
逻辑没有问题(反正可能性又不等于必然性╮(╯▽╰)╭)这个猜想实际上包括两部分:1、该基因与lncRNA相互作用;2、两者的相互作用与该疾病有关。入手的话,敲一下lncRNA看病理,敲一下基因看病理,过表达一下、RNA干扰一下啥的,这些都可以看是不是和疾病相关;相互作用的部分也有实验可以证明,间接到此结束了?。
要确定特定lncRNA的活动位置,通常需要借助实验技术,如RNA免疫荧光原位杂交(RNA FISH)。在实验前,预测工具如lncATLAS(lncatlas.crg.eu/)可提供参考。该数据库以15个细胞系的高通量测序数据为基础,收录了6768个经GENCODE注释的lncRNA信息,只需在界面输入lncRNA名称或ID,即可查询其在不同细胞系中的好了吧!
逻辑没有问题(反正可能性又不等于必然性╮(╯▽╰)╭)这个猜想实际上包括两部分:1、该基因与lncRNA相互作用;2、两者的相互作用与该疾病有关。入手的话,敲一下lncRNA看病理,敲一下基因看病理,过表达一下、RNA干扰一下啥的,这些都可以看是不是和疾病相关;相互作用的部分也有实验可以证明,间接到此结束了?。
其中一些研究已经确定了显示出与上述miRNA 面板相似的诊断性能的RNA 生物标志物特征。例如,剖析lncRNA 在匹配的术前和术后血浆、5 名胃癌患者的肿瘤和正常胃组织中的lncRNA 的检测结果导致5-lncRNA 指数的鉴定,随后在321 名受试者中进行了测试,可用于区分胃癌和健康对照,激用于区分胃癌和癌后面会介绍。
A 全转录组测序检测的是small RNA,circRNA,lncRNA及mRNA,目的是分析其在细胞中的互作网络关系,检测方案是建两个库(一个是small RNA数据量10M,一个是lncRNA+circRNA+mRNA数据量12G),其所需样本量大于转录组测序。互作网络分析图Q 转录组测序得到的结果验证方法有哪些?A qRT-PCR、Western blot等我继续说。
深度学习给生物学带来了哪些改变 -
将CNN应用于基于图像的基因表达数据的另一个机会是RNA原位杂交,这是一种繁琐的技术,当允许这样的操作时,能够使基因表达在一组细胞,组织切片或整个生物体中定位和可视化。这种方法促进强大的纵向研究,说明发展过程中的表达模式的变化。它被用于构建详细的Allen DevelopmentMouse Brain Atlas,其中包含超过2000个基因的表达还有呢?
2011年,Chung等报道了位于人染色体8q24的lncDNA即PRNCR1,他们发现PRNCR1与DD3/PCA3, PCGEM1一样具有抑制肿瘤细胞凋亡,促进肿瘤细胞增殖的作用,并且该lncRNA可能是前列腺上皮内瘤病的致病基因。抑制该基因的表达能够减弱前列腺癌细胞的活性,反式激活AR。这表明PRNCR1可能通过改变前列腺癌细胞AR的活性从而导致前列到此结束了?。