核苷酸同源性分析图怎么看
系统发育(Phylogeny)简介?？
如果同源性状状态只进化了一次并且在最初进化出这一性状的祖先的所有后裔中都保留了下来🎣|😽，那么这些共享的同源性状状态就提供了不同物种拥有共同祖先的最好证据😌|——🃏。比如🕊🐫——|🦃，马和斑马的一趾继承于他它们的共同祖先😶👻-——🦇。有同源相似的🐉🪅——🎄，就有非同源相似的(homoplasious)🐷☀️——🐥🪳。非同源相似指一个性状在多个物种中表现出相似性😾🦠————*，但是在不有帮助请点赞☺️_🏵*。
这个很有可能啊*|——🦟🎽，举一个简单的例子🥎🤖||🦦：ATG TGA 和ATG TGC 这两个序列的核苷酸同源性几乎是99 但是翻译出来的蛋白确实🦂——🦫😘：M 终止和M C🥊——|😷，氨基酸同源性只有50 这样能理解了？
如果同源性状状态只进化了一次并且在最初进化出这一性状的祖先的所有后裔中都保留了下来🎣|😽，那么这些共享的同源性状状态就提供了不同物种拥有共同祖先的最好证据😌|——🃏。比如🕊🐫——|🦃，马和斑马的一趾继承于他它们的共同祖先😶👻-——🦇。有同源相似的🐉🪅——🎄，就有非同源相似的(homoplasious)🐷☀️——🐥🪳。非同源相似指一个性状在多个物种中表现出相似性😾🦠————*，但是在不有帮助请点赞☺️_🏵*。
这个很有可能啊*|——🦟🎽，举一个简单的例子🥎🤖||🦦：ATG TGA 和ATG TGC 这两个序列的核苷酸同源性几乎是99 但是翻译出来的蛋白确实🦂——🦫😘：M 终止和M C🥊——|😷，氨基酸同源性只有50 这样能理解了？
我呆的组做同源性分析（印象里都是针对编码蛋白质的基因）有时是cDNA序列🦑🐙|_🦂，有时是AA序列*🐚-——🧿，貌似用AA序列为多🏐——-🐘。做RNAi时测序的克隆比对时一般就直接用测序的核苷酸序列（我们RNAi的克隆一般是针对外显子设计的片段⭐️|🐫，sourcebioscience的线虫genomic library）✨|-🦑🪅。一般来说🐁————🥅🐐，比较同源蛋白💥🐷|——🐖，用cDNA和蛋白序列都可以🐱|-🦜。
您好*🐿_🌤🌿，建议用序列两两比对算法做不同物种间核苷酸序列和氨基酸序列的同源性比对🐌——🌴🦇。将序列比对用于进化分析时🥇🐒|_🤣，处于相同位置的氨基酸/核苷酸位点则被认为在进化上是同源的🐌🦇||♠，并且具有共同的祖先🥊🎲-💐🎖。
基因核苷酸序列同源性比较用哪个软件?？
Cluster系列即可🦋😻-——🐃，在线的也有很多🪅|🦛🌙，比如Cluster Omega
图1. 病毒起源的三种假说[1]💮🦔_😗。病毒演化研究主要是通过病毒的基因组序列分析进行的😺|🌤，基因组结构类似或序列具有同源性🐰-——🤫🦅，则病毒具有亲缘关系🪢🙄————🧩，序列越接近😞-_🦢🎋，亲缘关系越近😮🐷——🎋😑，复制周期🦏😔|_🦃🐑、宿主范围🐙——🌤、致病性🪅🦂-🌕、免疫原性则往往越相似🐃🎖_——🤫🐄。从大的时间尺度来讲🌦-🐵🎿，由于病毒与细胞生物之间存在广泛的遗传信息交流🌺|🦎⛈，病毒在细胞生物演化中发挥巨大的有帮助请点赞😥🦐-|🎿。
...核苷酸序列和氨基酸序列与其它物种的同源性均达到80%左右,引物可用...
用一样的不好吧👺——-🎄，因为80%不代表引物那一段就相同啊🙁_-🕹🌹，特别是3’端的🌾——🐞🐿，如果不匹配的话很难扩增出来🐜-🤓🐷。可以多找几种跟你需要扩增那个物种亲缘关系比较近的物种🙈——|😸，找到他们的该基因的序列🐗🦉——🦇，比对之后设计简并引物🐒😶|🎏，这样可能会好一些🐕🦺🐯|-🌺🐲，
病毒基因组为单股正链RNA,由大约30000个核苷酸组成🦧🦠|🎋🎋，与经典冠状病毒仅有约60%同源性🥌——|🦥🌟，但基因组的组织动工与其他冠状病毒相似🤢-🌹🐅。基因组从5'到3'端依次为🐱-😻：5’多聚酶-S-E-M-N-3'😈_😸。5'端有甲基化帽子结构🐤*——🌥，其后是72个核苷酸的引导序列🏒_🕷。基因组RNA约2/3为开放新闻记者框架(ORF)1a/1b,编码RNA多聚酶(Rep),该说完了😯|——🤓。
微生物的分类?？
在DNA相关度低的菌株之间😦|🌑，rRNA同源性能显示它们的亲缘关系🥍🦩-|😤😷。Rrna-DNA分子杂交试验可没定Rrna的相关度🦀_|*🌿，揭示Rrna 的同源性😼🐲__🐪🃏。rRNA的碱基顺序RNA的碱基顺序由DNA转录来的🐘🌓-🌾🎮，故完全具有相对应的关系🦝🦝__*❄*。提取并分离细菌内标记的16SrRNA,以核糖核酸消化🌗_💀🐀，可获得各种寡核苷酸🎈🐐_🍁，测定这些寡核苷酸上的碱基顺序🖼🐑|*🐇，可作为说完了🐥😪-|🙃。
二.发现新基因和新的单核苷酸多态性发现新基因是当前国际上基因组研究的热点🦅🧐——|😱，使用生物信息学的方法是发现新基因的重要手段🌵_-🦅。比如🧧——_😫：啤酒酵母完整基因组所包含的约6000个基因🎲——_🌻🦑，大约60%是通过信息分析得到的🐙_☹️🤬。1)基因的电脑克隆利用E ST数据库发现新基因也被称为基因的电脑克隆🎇🦁_🐕🍄。E ST序列是基因表达的短c DNA序列还有呢？