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基因测序结果的图怎么看

2024-07-16 04:50:21 来源:网络

基因测序结果的图怎么看

帮我读基因测序的图,途中红圈的部分表示什么意思?谢谢。??
红圈的部分是该基因的整体示意图🐚|🦮🎨。细长线代表的是染色体DNA.方框代表的是外显子(exon)的位置🐈🎱-🎋🐣。涂黑的代表的是被翻译的编码区🪆——_😱。一头一尾的空白方框是非编码区🤕🦄-🦕😥。红圈上方的序列图😑🐊-😊,是表示3号外显子和内含子交界区序列(SD)🐊-🪶🌙。估计该基因有Alternative splicing😭-——🦚♦,也就是有不同的外显子拼接😸————🌔。这个测序结后面会介绍🐷_🥅😧。
1. 假设你测的是一个基因的序列🐃——🌷,如果已知这个基因的序列🤥🤿——🌾,则将你测序得到的基因序列与已知的序列相比对👺_🐹😊,分析看两者在哪个地方不对应🐆🐸-🎟👽,不对应的地方即为突变的地方🦃——🐭。比对的软件有sequencher🐁——🎉,或者去NCBI网站点击BLAST进行🍁🌿——🐒。2. 如果你测的是一个以前未知的序列🤬☄️_🦍🎑,那么要测几个不同的单克隆🪡🦢_😑,将测得的结等会说🐫😾-🐷🐓。

基因测序结果的图怎么看

如何看懂基因测序的circo图??
拷贝数变异(Copy number variation, CNV)是由基因组发生重排而导致的🦧-_🦘*, 一般指长度为1 kb 以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少🎑|-🐇, 主要表现为亚显微水平的缺失和重复🥇_😯。CNV 是基因组结构变异(Structural variation, SV) 的重要组成部分🕷_🐈。CNV位点的突变率远高于SNP(Single nucleotide polymorphism), 是人好了吧*🏆||😳🤯!
现在测序后🪰-🦄😪,一般都是机器阅读😬|🙂,你要自己阅读的话🐖🏅_-🤪,就照DGGE后顺序🎁🧿————🦫,拿着胶😘🙊|🎯😅,按分子量从大到小一个一个读就好了🐱🐽_🐰。
实验室菜鸟一枚,做的基因pcr后测序,用geneious软件对比,可完全不会看...
比对结果简单的说是为了让两条或者多条不同长度序列通过一致性的比较🐚🎎——🐦😾,掐头去尾🐍——-🌳🙀,使其变成具有可比性的多条序列😂——_🐤🌼。如上图💐——🥋🐋,出现很多的空格🎣——😝💫,就是为了让两条序列有一致性🥍🐦|🐜,软件自动添加的🌹_🦆🥋。比对之后下一步就是进行系统进化树绘制🦘_——🐾🐈‍⬛,使用mega等软件对比对好的序列进行系统进化分析···然后出图😟——_🐐,描述🐈-🦛🕸,写到此结束了?🌼|🏸。
首先🦡😯——🎣🐒,看测序峰图😍——|🧐🦟,如果结果的彩图显示峰型是尖锐单一的🐀😪_——🐏😂,碱基所对应的编码是一致的🌲-🐿,那么可以判断序列是可以使用的🐯|⛳🤕。如果出现双峰🪢😑_*🧐,信号中断等异常现象🎏-_🏏,那么需要重新制备或者克隆后再测序🐂||🐐🧧。一般情况系是通过荧光定量PCR🐈|_🐕‍🦺,可以测定目的基因相对于标准基因的倍数🌘|☺️🐗,选取一定的基准🦝——🐞,就能知道目的基因的数量🦀-*🍁。但是希望你能满意🦌-_😩*。
DNA峰图怎么判断结构、移码、结合之类的??
因为测序本来就是一个PCR反应*🐿——🙂,如果引物多位点结合🕸|🧶,产物就不是单一产物🔮🌚_🌟,表现在峰图上就是套峰😱🌝——|*。例如🦓_😖🏆,上图中每个位置除了一个主峰之外还有一个不可忽视的小峰🐦——🪅😆,说明引物结合在两个不同的位置🎑🍂||🙂🤤,测序的结果有两个🦧_🦈🕸,即主峰和套峰♠——_🥀。产生这个问题的原因可能是测序引物设计的问题😕😺_🌸♣,也可能是模板不纯😯🌪——🪆🔮。
首先⛅️——🦣😵,你要把这个基因的起始位点标出来💐-|🐿*,就给这么点序列🐯-——♟,不好给你分析🛷-🤤。上面的DNA序列也不像从头开始的啊🕷🐑|🦄🐬。下面的RNA序列也不知道是从什么地方开始的*🏓_|🎍🥍。这段基因到底是在基因的什么位置?设计realtimePCR引物🦝🌍——|🐏,一般选择mRNA的前边部分🦛😡--🐪🦅,另外🙊——_🕷🪅,你这段序列的长度也不够*|_🐈,一共才119bp🥅——🌔🏸,扩增出来也不好区分到此结束了?🥎——🦈。
如图是科学家对果蝇正常染色体上部分基因的测序结果.请据图回答:(1...
(1)等位基因是指位于一对同源染色体的相同位置🐦🌵——🍄,控制着相对性状的基因😿——*‍❄,故图1中的朱红眼基因与图3中的深红眼基因为非等位基因.(2)基因控制的性状不一定都能在后代表达出来🏅_-😩,因杂合体中🐞_-🤥🦙,隐性基因不能表达🥉🦍|_😱🌖,且性状的表达是基因和环境共同作用的结果.(3)图2中Ⅰ基因编码区是连续的🦙|🎴,故为原核等我继续说🦊😭——🤕🦭。
在我们之前的推文中提到过🐗🦌-🐏🥇,桑格测序是CRISPR-Cas9基因编辑结果的金标准😪_-😳。一般我们先将多个单克隆细胞的PCR产物送测序😋😊|_*,选择拥有套峰的单克隆细胞进行T载体连接测序🌸-🎋,用以检验最终的基因型🌚-——🐭🎲。关于如何解读桑格测序封图😔🐁|🪅🦂,可以参考测序公司给的文档🥋——*,感兴趣也可以点击我们之前的文章💮-🐪:看不懂测序峰图就好像有希望你能满意*|_🍂。