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什么原因造成GC含量高

2024-08-08 11:55:18 来源:网络

什么原因造成GC含量高

什么原因造成GC含量高??
GC含量高😠_-🐍🏈,一般见于高等动物(包括人)基因的调控区🐌|_👿。CpG是DNA甲基化的位点🐸——🎖😕。甲基化后🥎😯-_🦋🪱,DNA转录降低🤯|-🎲。是一种调控手段🤔🕷-😺🎆。在进化过程中🐽😨|🐱🧿,基因调控区的变异要大于编码区🍀💐————😐🦎。因为编码区突变有可能造成致死性功能改变🌿|-🌟。而调控区的突变则有可能引入更多的GC🎖🐿-😙。
【答案】🦫--😬🎇:GC含量为70%的Tm值高🖼🐄_——🤣。因为G-C对之间有3个氢键😱——🤑,而A-T对之间只有2个氢键🐆-🦙🧧。考点]影响DNA的Tm值因素🐣🖼_🏆。DNA的Tm与下列因素有关🐩——|🐜🌍:1)DNA的均一性✨-🏅🏐:均质DNA的熔解过程发生在一个较小的温度范围内🥍-🎄⭐️,异质DNA熔解过程发生在一个较宽的温度范围内🤗🙄_🎳⛸;2)GC含量🐖————*:在pH 7.0🌒|🐰,0.165 mol/L的说完了🐏🦑——🪶。

什么原因造成GC含量高

GC键多的基因片段,退火温度变高还是变低???
GC含量高😑-🐱🥉,说明解链温度高目的条带在较高温度才会解链🐚|🎍,而在未达到解链温度时🏒🌾_-🌍🌷,引物会以未完全解链的DNA为模板😌——🕊,进行PCR非特异性扩增🏑*——*,所以易出现非特异性条带🐑|-🐫。降低退火温度🐀🐚_🐓,DNA复性减缓🌚_😫,增加非特异性互补机会🦗-|🌻😦,使非特异性条带增多🎍🐪|🐀🐅。
55摄氏度🌵——🐏🦩。gc是PCR技术中的一项元素🦅🐗——🦄*,在该技术中🌴🌍|-🌪😧,GC含量高🦋🙂|——👹🥇,说明解链温度高🦊——🦊😨,GC含量最高为0.8时🌱*——😾🦛,其退火温度就等于55摄氏度🌴🌱——🐼,退火温度可提高反应的特异性🐑——🎎🎽。
为何gc含量高不利于退火呢??
解链温度高*__🧶。在化学结构中GC之间有三个氢键🦟😤|🎲,条带在较高温度才会解链🐾🐚————🐳🎎,而在未达到解链温度时🐄🐿||*,引物会以未完全解链的DNA为模板🌘😀——🤥☀️,由于解链温度高🦈🎰-|💫,gc含量高不利于退火🐈🍂__🐏。GC含量是在DNA4种碱基中🌟🌖_-*💐,鸟嘌呤和胞嘧啶所占的比率称为GC含量🏉-|🌳🍃。
楼上的回答不错🐷🎟-|🎭🏉,GC之间有三个氢键🦈-🐒,稳定性较高🌧-🏒,相对于AT之间的两条氢键而言🐫⛸_*🪁,GC之间难以断裂😌🎰————😓😡,而AT之间的氢键断裂程度比GC高🌥🌵——🦨😞,所以在DNA扩增后🍄_🏸,AT复制的比较多🌦|-🦛🍁,所以含量高🦆-|🧩🦀。
为什么gc含量高不好进行pcr??
gc之间3个氢键🐬🐉|_🐔🌵,打开时需要的能量更多🦏-🏈🎏,被扩增的机会相对少🐲🍂-🌷😰,导致最终pcr结果中低gc含量的片段扩增的比高gc含量的片段多🕷🦖|_🌑🦕,
早S期早复制的是GC含量高的DNA序列🧨——😥🎽,而晚复制的DNA序列AT含量高在真核生物的染色体中🧿-🐱🦊,一般着丝粒区富含AT碱基对🦓🤠-🕹,属于异染色质区🐈-——🦊🦠,该区域是延迟复制的区域🐉————🐰,甚至会延迟到M期开始才开始复制*_🐋🐽。
克隆全长的时候反向引物GC含量太高怎么办??
方法如下😈🤑_🦡🎀:1)一般的公司有提供专门扩增高GC序列的酶和buffer提供😹_|🏈🏅,可以考虑😅————🐈🪳,我们用宝生物的LA酶和GCbuffer🎄🍂_🦗。2)可以将序列扩增长一些🦅-|🐯,避免引物GC含量过高的区域🐓——_🧵,2步克隆😔🎄——😼。3)反应中加入DMSO等改进方法也是可行的🎀*_🦍🌩,但对GC>75%的可能没有效果的🐣🌼|🐉🐊。4)序列不长的话*——🌾🦜,可以考虑人工合成🤗|-♠🦢。
TakaRA有一种酶叫做TakaRa LA Taq酶是专门对高GC含量的🦅_😛🦌,当扩增具有复杂的二级结构(GC rich等) 的模板或具有重复序列的模板时🐄🦆|🍂*,使用GC Buffer进行PCR扩增将非常有效.里面有两种GC buffer,如以人基因组DNA为模板🥌|——😪,