RAce获得基因全长后怎么分析它的结构比如开放阅读框及其长度、...
如何让设计引物?？
你的序列是全长吗？如果不是🦇|🐞，可以根据这段序列🙂♠_——🪄🎽，先设计3'race和5‘race引物🪳😆——🐬。得到序列全长之后🐺🦇-_🦉🦧，分析开放阅读框（ORF）🌲🦀-|🍂🦆，根据ORF🥋_——🌕，设计引物🧨🎫-🐲，表达蛋白😇-🕷。
5'端🐀🐞|_🦕：如果有同源全长基因的比较🐘🐙——-😢🐗，可以通过与其它生物已知的对应基因5'末端进行比较来判断☺️🐡-🦜🥊。如果无同源基因的新基因🦠🐲|_🍁🤯，则首先判断编码框架是否完整🦂🐲-|😂🐡，即在开放阅读框的第1个ATG 上游有无同框架的终止密码子🦒🐁-🙁；其次🕹——-🥎🪲，判断是否有转录起始点😾|🦡🤭，一般加在5'帽结构后有一段富含嘧啶的区域🦩|🪡，或者是cDNA 5'序列与基因组序列中经过后面会介绍😑🦟——_🌼🦚。
你的序列是全长吗？如果不是🦇|🐞，可以根据这段序列🙂♠_——🪄🎽，先设计3'race和5‘race引物🪳😆——🐬。得到序列全长之后🐺🦇-_🦉🦧，分析开放阅读框（ORF）🌲🦀-|🍂🦆，根据ORF🥋_——🌕，设计引物🧨🎫-🐲，表达蛋白😇-🕷。
5'端🐀🐞|_🦕：如果有同源全长基因的比较🐘🐙——-😢🐗，可以通过与其它生物已知的对应基因5'末端进行比较来判断☺️🐡-🦜🥊。如果无同源基因的新基因🦠🐲|_🍁🤯，则首先判断编码框架是否完整🦂🐲-|😂🐡，即在开放阅读框的第1个ATG 上游有无同框架的终止密码子🦒🐁-🙁；其次🕹——-🥎🪲，判断是否有转录起始点😾|🦡🤭，一般加在5'帽结构后有一段富含嘧啶的区域🦩|🪡，或者是cDNA 5'序列与基因组序列中经过后面会介绍😑🦟——_🌼🦚。
如果严格需要克隆一个基因的全长🐟——😶，那么最好的办法就是用RACE了🦃🐁|🌴🌴。如果不是严格需要全长🎱☁️_🎳🦊，你已经得到了大部分序列🤒-|🦘，并且认为剩下的序列也不太重要🐂🙂——_🐟🤒，那么就直接cDNA扩增即可💀🤢-——🌵。
3.从茶树全器官转录组文库中筛选出POD57的EST片段☹️_♠🏵，以茶树叶片为试验材料🥏__😑，通过RACE技术克隆得到该基因cDNA全长序列为1273bp,包含一个长为957bp的开放阅读框🐷-🦔，编码318个氨基酸🌖|-🦂，存在一定的内部跨膜结构🎄😝|-🐍。组织特异性分析表明🌴——😕，该基因主要在根中表达🐾🦧——-🐸🐌。4.定量PCR分析生根期间POD57表达量🐲💫|🍂，结果表明皖茶91和舒茶早后面会介绍🐨*-*😵。
真菌基因克隆以后 怎样分析的它的调控?？
并根据CaM基因cDNA全长序列设计基因特异性引物扩增玉米大斑病菌基因组DNA获得了该基因DNA全长🐷🌴|🐞。利用BLASTX软件与GenBank中已知蛋白进行同源性分析🐤|🐳，发现该开放阅读框所编码的氨基酸序列与许多真菌如水稻胡麻斑(Cochliobolus miyabenus)🌘——🎏、小麦颖枯病菌(Phaeosphaeria nodorum)🍂_💐🎱、稻瘟病菌(Magnaporthe grisea)等的钙等会说🦫-_🤧。
在第一个反应中由于含有dNTP+ddATP, 所以遇到G, T, C三个碱基时没什么问题♥||🐣， 但遇到A时🎨|🌾🌲， 掺入的可能是dATP或ddATP, 比如已合成到G, 下一个如果参与反应的是ddATP则终止🦅🌏__🌿🎁， 产生一个仅有2个核苷酸的序列🐍|🙂： GA, 否则继续延伸🧨_-🎑， 可以产生序列GATCCG, 又到了下一个A了. 同样有两种情况🦒🤫|*， 如果是ddATP说完了🦍_🎋😆。
第二代DNA测序法的原理能解释一下么?主要想问:1.双脱氧核苷酸终止子是...
1.2.1 直接从序列上评价5'端🎮🐅——😞🦮：如果有同源全长基因的比较🏆🥅_🐩，可以通过与其它生物已知的对应基因5'末端进行比较来判断🪶🌹——✨。如果无同源基因的新基因💀🪄_🍄，则首先判断编码框架是否完整🌻♦——⚡️，即在开放阅读框的第1个ATG 上游有无同框架的终止密码子🎭🐨——🦝🌾；其次🐃🦔_😵🧿，判断是否有转录起始点🐲_|😥，一般加在5'帽结构后有一段富含嘧啶的区域😟_——🐺🎍，或者是cDNA 到此结束了？🌷——🌒。
1 ]首次从芒果中分离到选择性氧化酶基因🦣🪴——🏆*，用PCR引物扩增了芒果叶片基因组DNA,获得了1个623 bp的可编码207个氨基酸的开放阅读框🐤*-_☁️🏏，用此片段筛选成熟芒果中果皮cDNA文库🤐😥——🐖，得到了1个全长cDNA克隆PAOM I. 1,可编码318个氨基酸🦘-_😺🎫，与大豆🦖_🥋、拟南芥同一基因的同源性分别为64%和68%, Southern杂交显示为单拷贝基因🎗😀|——🎁，后面会介绍🎫——🐑。
【文献分享】探索作物中的广谱抗病性?？
Race-nonspecific broad-spectrum resistance(RNS BSR): 植物对同一病原菌的多个小种产生抗性🌸🤗_😗。育种家早先使用单显性或隐性的R基因🤣🍀——_🐯😴，因为它们效应强且容易选择🐊🐏|☺️🦇。大多数基因具有对单一或少数病原菌的特异小种产生抗性😱_😰🦎；然而🐖*|🌘🌞，致病菌种群的突变和毒力的转移使这些抗特异小种的R基因有效性很短🐡——_😹😝，而由QTLs控制的部分抗病性等我继续说🍁|-🌻。
5'端🌹|🧶☁️：如果有同源全长基因的比较💐——|**，可以通过与其它生物已知的对应基因5'末端进行比较来判断😼😬|-🙈🐑。如果无同源基因的新基因🏆——-🐰，则首先判断编码框架是否完整🐭————🎇🐍，即在开放阅读框的第1个ATG 上游有无同框架的终止密码子🏆😡——🦄*；其次💥🦇||🐷，判断是否有转录起始点🐾——-🐀🐃，一般加在5'帽结构后有一段富含嘧啶的区域🦃🤣-|🤫🥉，或者是cDNA 5'序列与基因组序列中经过还有呢？