当前位置 > 基因数据解读基因数据解读及标准
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基因表达数据的聚类分析方法
数以千计的基因以不同的量一起表达。 例如,不同类型的癌症在人类中引起不同的基因表达模式。可以使用微阵列( Microarray )技术研究不同条件下的这些不同基因的表达模式。 来自微阵列的数据可以想象为矩阵或网格,矩阵中的每个单元格对应于特定条件下的基因表达值。 如下图所...
2024-08-14 网络 更多内容 939 ℃ 265 -
基因数据格式
分隔符表示等位基因是否分型过phased (‘|’)或者unphased (‘/’)。根据不同分析可能依赖侧重的信息不同,就不一一列举了,有文已经解释的比较清楚,可以按需查询。 Quality (Phred) scores NGS数据格式02SAM/BAM最详细解读 知乎 variant call format and VCFtools | Bioinformati...
2024-08-14 网络 更多内容 646 ℃ 597 -
基因芯片数据分析1: 使用GEOquery 包从GEO获取数据
GEOquery 包使用指南 GEO(The NCBI Gene Expression Omnibus)是NCBI专门储存高通量测序的库。如基于芯片数据(mRNA、DNA、蛋白丰度),蛋白质质谱数据和高通量测序数据。 GEO数据主要有4种基本类型。Sample, Platform 和 Series是由作者上传的数据,dataset是由GEO官方从...
2024-08-14 网络 更多内容 483 ℃ 628 -
如何快速地分析基因结构和基因家族
水稻OsMKK基因家族的结构和表达分析OsMKK是水稻MAPK途径中位于中游的一个分裂原蛋白激酶激酶基因家族,主要承载着上游信号的汇聚、逐步向下扩散传递的作用。它们在水稻生长发育和逆境反应中的功能目前还不很清楚。干旱、低温、盐害等非生物逆境是影响水稻产量的重...
2024-08-14 网络 更多内容 588 ℃ 488 -
ssr基因型数据可以用哪些软件分析?
重组自交系 有两个亲本。取两个亲本的某个标记的带型分别为1,3,杂合型为2.然后 你后面照着读就可以了。就是扩增pcr时候要带上两个亲本一起来做扩增,一起跑
2024-08-14 网络 更多内容 955 ℃ 187 -
转录组数据分析
想要做好数据分析,先要多读点书 数据分析方面个人推荐书目: 1、《统计与真理——怎样运用偶然性》 2、Google Analytic经典分析 3、统计学:从数据到结论(吴喜之)第二版 4、统计数据标准化方法 补充几本书: 1、统计学的世界 2、民生数据的真相 3、统计陷阱
2024-08-14 网络 更多内容 432 ℃ 436 -
基因的构成
基因是dna的片段,是由脱氧核糖核苷酸构成的,属于很多分子构成的,是生物大分子
2024-08-14 网络 更多内容 324 ℃ 673 -
怎样从芯片数据中挑选基因做gsea分析
当人类基因体定序计划的重要里程碑完成之后,生命科学正式迈入了一个后基因体时代,基因芯片 (microarray) 的出现让研究人员得以宏观的视野来探讨分子机转。不过分析是相当复杂的学问,正因为基因芯片成千上万的信息使得分析数据量庞大
2024-08-14 网络 更多内容 321 ℃ 95 -
什么是基因数据GeneData ?
基因测序是近年来生物医学领域最受关注的前沿技术之一,它能够为患者打造更精确、更具针对性的治疗方案。基因组学都是涉及个人隐私数据,基因组数据对个人疾病预防、遗传病和健康状况有着很好的指导作用,目前基因数据和健康数据,都集中在独立的第三方机构储存和管理。不仅...
2024-08-14 网络 更多内容 945 ℃ 266 -
ssr 基因型数据可以用哪些软件分析
重组自交系 有两个亲本。取两个亲本的某个标记的带型分别为1,3,杂合型为2.然后 你后面照着读就可以了。就是扩增pcr时候要带上两个亲本一起来做扩增,一起跑
2024-08-14 网络 更多内容 124 ℃ 927
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