当前位置 > TCGA肿瘤微生物组分析tcga肿瘤微生物组分析指南

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  微生物基因组的介绍

  本书是由微生物基因组学开创者们撰写,重点介绍了10年来微生物学转向全基因组序列研究的进展,包括微生物基因组学的历史、作为基因组学工具的生物信息学、核心功能、微生物基因组的进化、微生物基因组的调查和基因组数据库的应用共6个部分。

  2024-08-08 网络 更多内容 388 ℃ 531
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  tcga数据库样本哪些是肿瘤哪些是正常

  有174个样本类似于这个:TCGA-06-0681-11A-41R-A36H-07  TCGA-06-0649-01B-01R-1849-01 第四个字段:11A和01B描述的就是样本类型,1-9是肿瘤,10-19是正常,20-29是对照。A 和 B 我也不知道啥意思。由于TCGA barcode 字段宽度是严...

  2024-08-08 网络 更多内容 199 ℃ 827
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  环境微生物宏基因组测序结果如何分析?

  宏基因组即生境中全部微小生物遗传物质的总和。它以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象, 以功能基因筛选和测序分析为研究手段, 以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的。宏基因组学技术第一次使人类得以研究占环...

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  土壤微生物聚类分析核心微生物图怎么看

  微生物物种多样性主要从对微生物类群即细菌、 真菌和放线菌这三大类群的数量及其比例组成来描述微生物多样性, 或者按照微生物在生态系统中的作用将其划分成不同的功能群(function group), 通过某一功能群中物种的分类及其数量来研究土壤微生物多样性, 如对土壤中的产甲烷细菌...

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  环境微生物宏基因组测序结果如何分析?

  宏基因组即生境中全部微小生物遗传物质的总和。它以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象, 以功能基因筛选和测序分析为研究手段, 以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的。宏基因组学技术第一次使人类得以研究占环...

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  免疫组化结果分析

  不是淋巴瘤,但转移性低分化癌是明确的,但可能因为肿瘤分化程度低,无法判断是腺还是鳞 来源。上面后面的免疫组化是鉴别诊断用的,你不用去理解,病理科医师懂就行。 CK7是腺上皮标志,CK5/6是鳞状上皮标记。EMA是细胞膜蛋白标记,CK是广谱角蛋白标记,S100是神经分化及组织细...

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  有参转录组分析

  进一步完善索引 随后利用 ballgown 或者 featurecount 得到表达矩阵进行下游分析 对于可变剪切一般使用 rMATs 进行统计,rMATS是一款对RNASeq数据进行差异可变剪切分析的软件。其通过rMATS统计模型对不同样本(有生物学重复的)进行可变剪切事件的表达定量,然后以likelihood...

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  转录组数据分析

  想要做好数据分析,先要多读点书 数据分析方面个人推荐书目: 1、《统计与真理——怎样运用偶然性》 2、Google Analytic经典分析 3、统计学:从数据到结论(吴喜之)第二版 4、统计数据标准化方法 补充几本书: 1、统计学的世界 2、民生数据的真相 3、统计陷阱

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  免疫组化结果分析

  这是胃肠道癌术后的常规检测,是为了除外林奇综合征(Lynch Syndrome),林奇综合征是一种常染色体显性内遗传疾病,基容因突变后引起的结肠直肠癌、子宫内膜癌、胃癌的遗传易感性增高。检测基因包括MLH1, MSH2, MSH6等。如果结果阳性,提示在林奇综合征基因上存在致病突变,增...

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  细菌全基因组分析

  测序只是最基础的,接下来你要做功能基因分析,查找确定哪=一=些是编码基因的序列,然后做表达检测。。 如果你事先知道自己的目的基因序列,测序结束后,应该可以直接找到。

  2024-08-08 网络 更多内容 191 ℃ 859